Nutanix offre funzionalità di sicurezza complete con crittografia validata FIPS, microsegmentazione, e architettura zero‑trust. La piattaforma è conforme allo status FedRAMP‑ready e alle certificazioni Common Criteria e PCI‑DSS. Include STIG preconfigurati, correzioni automatiche delle criticità di conformità, e gestione centralizzata delle policy per implementazioni on‑premise, edge e ibride – il tutto nel pieno rispetto degli standard FISMA e HIPAA e delle normative sulla privacy dei dati.